Aizanoi Antik Kenti, tarihi boyunca pek çok medeniyete ev sahipliği yapmış ve zengin kültürel mirasıyla dikkat çekmiştir. M.Ö. 3000 yıllarına kadar uzanan geçmişi, Helenistik dönemden Roma İmparatorluğu'na kadar birçok önemli aşamayı içermektedir. Zamanla, tarım ve ticaretin merkezi haline gelen bu kent, Bizans döneminde de stratejik bir önem taşımıştır. Günümüzde, kazı çalışmaları sayesinde geçmişe ışık tutan Aizanoi, ziyaretçilerine tarih boyunca yaşananların izlerini sunmaktadır.

Aizanoi Antik Kenti'nin tarihi, M.Ö. 3000 yılına kadar uzanmaktadır. Kentin tarihçesi şu şekilde özetlenebilir:

• Helenistik Dönem. Aizanoi, bu dönemde Bergama ve Bithynia arasında el değiştirmiştir.
• Roma Dönemi. M.Ö. 133'te Roma egemenliğine girmiş, tahıl, şarap ve yün üretimiyle zenginleşmiş ve ünü bölge sınırlarını aşmıştır.
• Erken Bizans Dönemi. Aizanoi, bu dönemde piskoposluk merkezi olarak önemini korumuştur.
• 7. yüzyıl. Aizanoi, bu dönemden itibaren önemini yitirmeye başlamıştır.
• Selçuklu Dönemi. Tapınak tepesi, Çavdar Tatarları tarafından bir iç kaleye dönüştürülmüş ve bölge Çavdarhisar olarak anılmaya başlanmıştır.

Aizanoi, 1824 yılında Avrupalı gezginler tarafından yeniden keşfedilmiş ve 1926'dan itibaren Alman Arkeoloji Enstitüsü tarafından kazılar başlatılmıştır. Günümüzde kazı çalışmaları Pamukkale Üniversitesi tarafından yürütülmektedir.